這一季的故事發生在上一季的3年后。這一季里，托尼（卡洛斯·博納德 Carlos Bernard 飾）和米歇爾（蕾可·艾爾絲沃斯 Reiko Aylesworth 飾）結婚了，并且成為了CTU的主管，而杰克（基弗·薩瑟蘭 Kiefer Sutherland 飾）的女兒金姆也加入CTU成為了一 名情報分析員。劇情由一具被扔在洛杉磯衛生中心外并感染了致命病毒的尸體開始。一個墨西哥毒梟為了讓美國政府釋放自己的哥哥，以致命病毒為恐嚇。杰克也因此又踏上了反恐調查之路。而這一季里面，杰克的調查并不順利，為了打入毒販